孔贞运（1574年—1644年），明朝大臣、诗文家，字开仲，号玉横，江左池州府建德县（今安徽省东至县）人，祖籍山东曲阜。孔闻敕次子。孔子的第六十二代孙。生于万历二年（1574年），万历四十年（1612年）乡试中举。万历四十七年（1619年）成己未科庄际昌榜进士第二人（榜眼），授翰林院编修。天启五年（1625年），充任会试考试官，充经筵展书官，纂修两朝实录。天启七年，升左春坊左谕德。崇祯元年（1628年），擢国子监祭酒，进少詹，仍管监事。崇祯六年，服阕，起南京礼部侍郎。后转北京吏部左侍郎。崇祯九年，入阁，官至首辅，宽复社狱，不逮问张采、张溥。寻引归。崇祯十七年（1644年），闻崇祯帝哀诏，恸绝遽卒。谥文忠。《明史》有其传。著有《光宗实录》、《嘉宗实录》、《词林会典》、《皇明诏制》、《制诰全书》、《御敌城守应援数策》、《敬事草》、《行余草》、《古今奇文品胜》、《节寰袁公墓志铭》等。其兄孔贞时（原讹作孔有时。据笔校改。由此校阅者所批，亦可见孔贞运家世之一端矣（引自《明清进士题名碑录索引》）），亦有文采，著有《鲁斋集》。