孙清天才俊逸，才能秉赋出众，不同凡响，在文学方面很有名气。弘治十一年（1498)中顺天府乡试第一名，解元。弘治十五年(1502)，会试第二十六名。殿试高中榜眼后，授翰林编修，是明朝少年进士之一。后改任陕西提学副使。孙清未见大用，很早就去世了。余事不详。