黄芊芊出生于2002年，晋江池店人，是目前中国女花重点培养的新星，曾获得2019年亚少赛女子花剑团体金牌。在今年6月举行的击剑亚锦赛上，黄芊芊携手陈情缘等队友收获女子花剑团体亚军。
2019年2月27日，2019年击剑亚青赛在约旦首都安曼揭开战幕。女子花剑比赛中，中国选手顾君、黄芊芊并列第12。
2019年3月1日，在约旦萨勒特市进行的2019年亚洲青年击剑锦标赛，女花团体赛，由黄芊芊、顾君、宋世弘、宋玥组成的中国队，以39：29的比分击败韩国队夺冠。
2021年9月20日，在第十四届全运会女子花剑团体决赛中，由黄芊芊等人组成的陕西队获得季军。
2022年9月，2022年全国击剑冠军赛(青岛站），由陈情缘、黄芊芊、林绮雯组成的福建队拿下成年组女子花剑团体赛冠军。
2023年，入选2023年国家击剑队第一期集训名单。
2023年1月，参加国际剑联花剑世界杯巴黎站比赛中，由陈情缘、石玥、蔡苑廷和黄芊芊组成的中国队获得女子团体第5名。
2023年3月，在国际剑联2022/2023赛季世界杯系列赛——女子花剑世界杯第三站，由陈情缘、黄芊芊等队友组成的中国花剑队获得团体赛第六名；在女花世界杯个人赛，黄芊芊获第28名。
2023年4月13日，2023年全国击剑冠军赛分站赛(第一站）在山东青岛开赛，黄芊芊在成年女子花剑个人四分之一决赛中不敌林绮雯，止步八强，最终获得第七名。
2023年4月16日，在2023年全国击剑冠军赛展开成年女花团体赛中，陈情缘、黄芊芊、郑璐璐、庄昕怡四人组队，斩获成年女花团体第一名。6月7日，国际剑联2022/2023赛季世界杯系列赛第比利斯女子花剑世界杯，陈情缘、黄芊芊、石玥、林绮雯收获团体赛第7名。
2023年6月18日，2023年亚洲击剑锦标赛男子重剑、女子花剑个人赛在江苏省无锡市太湖国际博览中心举行。女花方面，黄芊芊不敌队友陈情缘无缘四强。6月21日，在2023年亚洲击剑锦标赛，由陈情缘、蔡苑廷、黄芊芊和傅依婷组成的中国女子花剑队摘得女子花剑团体赛银牌。
2023年7月，入选2023年米兰击剑世锦赛中国队参赛名单。7月，参加第31届世界大学生夏季运动会击剑-女子花剑个人项目。8月6日，第31届世界大学生夏季运动会女子花剑团体金牌赛，所在的中国队获得金牌。8月，入选杭州亚运会击剑项目女子花剑团体赛及个人赛名单。9月1日，2023年全国击剑冠军赛(总决赛）结束了全部个人赛争夺，女子决赛，黄芊芊获得亚军。9月3日，在2023年全国击剑冠军赛总决赛中，所在的福建队夺得女子花剑团体冠军。9月4日，2023年全国击剑冠军赛总决赛，黄芊芊获得成年女子花剑个人亚军，陈情缘黄芊芊焦恩祺庄昕怡组成的福建队获得成年女子花剑团体冠军。