刘余祐（？－1653年），字申征，一字中徽，号玉吾、燕香居士，(室名)燕香斋。明末清初政治人物，顺天宛平人。
明万历四十四年（1616年）进士。曾任嘉兴、登封县、河内县知县。累官刑部主事、刑部郎中、平阳府知府。崇祯元年，升任河南副使、陕西副使、分守河南道按察使、河南布政使、应天府尹，工部侍郎、兵部左侍郎等职。明亡，附李自成，清军入关，又降清，仍授原官。顺治五年（1648年）任兵部尚书，次年加太子太保。顺治八年，改任刑部尚书，加少保。顺治九年，官至户部尚书；顺治十年（1653年）因事被革职，不久卒。