沈自尹，中西医结合学家。1928年3月22日出生，浙江镇海人。1952年毕业于上海医学院医学系。上海医科大学华山医院教授。1997年当选为中国科学院院士。
率先对中医称为命门之火的肾阳进行研究，发现肾阳虚证病人，其反映肾上腺皮质功能的尿17-羟皮质类固醇值明显低下，经补肾中药治疗可以恢复正常。这一结果得到国内7个省市以及日本高雄医院等研究单位的重复与公认。通过对同病异证组进行下丘脑-垂体-靶腺轴功能的对比研究，推论肾阳虚证主要发病环节在下丘脑。这一成果的意义是首次用现代科学方法在国际上证实肾阳虚证有特定的物质基础。通过采用分子生物学方法，证实唯有补肾药才能作用并提高下丘脑的双氢睾酮亲和力及CRF基因的表达，对肾阳虚证达到能定性、定量以至将主要调节中枢定位在下丘脑提出多方面的有力证据。
沈自尹院士是中西医结合学科的开拓者之一，中西医结合思路和方法、脏象学说和病证关系研究的开创者之一。率先发现肾阳虚证者存在下丘脑-垂体-肾上腺皮质轴功能低下和紊乱，并用现代科学方法证实其有特定病理基础，在临床进行支气管哮喘、肾病综合征激素依赖等中医药治疗研究，开发新药急支糖浆、补肾益寿胶囊、补肾防喘片等。
沈自尹院士曾发表论文100余篇，主编学术专著6部，培养硕士、博士研究生30余人，获国家科技进步二等奖等省部级以上奖励20余项。
中国共产党党员、中国科学院院士、复旦大学附属华山医院教授沈自尹同志，因病医治无效，于2019年3月7日7时22分在华山医院逝世，享年91岁。