邱灵鞠（？—484后），乌程（今湖州）人。少时好学诗文。初任州从事，举秀才，任州主簿，累迁员外郎。南朝宋时，殷贵妃亡，灵鞠献挽歌、挽诗三首，内有“云横广阶暗，霜深高殿寒”句，孝武帝称赏不已，除新安王北中郎参军。出为乌程令，郁郁不得志。泰始初，坐事免职。闲居数年，待褚渊荐明帝，委其著《大驾南讨记论》。后除太尉参军，转安北记室，带扶风太守，不就任。拜尚书三公郎、建康（今南京）令，转通直郎，兼中书郎。
昇明中（477—479），迁正员郎，领本郡中正，兼中书郎。南齐建元元年（479），转任中书郎，中正职不变。不久，掌知国史。次年，出为镇南长史、浔阳相。迁尚书左丞。齐武帝即位，转通直常侍。不久，领东观祭酒。永明二年（484），领骁骑将军，改正员常侍。
负有文名，好饮酒，常蓬头披发，仪态不整。著有《江左文章录序》、《起太兴讫元熙文集》。