程元章（？～1750），字冠文，号垣文，河南上蔡人。清康熙六十年（1721）辛丑科邓钟岳榜进士第三人。
程元章考取进士后授翰林院编修。雍正元年，程元章出任四川乡试副考官。三年后以詹事府少詹事，提督福建学道。雍正七年，他由福建学政，改任浙江承宣布政使。雍正十年，程元章由安徽巡抚，升任浙江总督兼兵部右侍郎，管巡抚事，第二年又出任为浙江总督。以总督兼理盐政巡盐御史。雍正十二年，他以总督衔，专管巡抚事。此期间，程元章上奏灾情，前些时候天旱，后来连绵雨不断。雍正亲自朱批：“汝自督浙以来，屡著种种灾异，莅政临民必有不合天心处，亟当返躬自省，勉图迁改。”程元章又上奏：“六月二十日晚，海潮汹涌，浪高丈余，风激未退。次日早潮，风势更烈，潮水扑上海塘，致草、石旧塘坍塌一千余丈。二十四日，尖山新修大条石塘突然陷落三十六丈，塌陷处水深二丈，正督工抢修。”雍正帝批在他的奏折上：“朕实代汝忧之”。过了些时候，程元章又上奏说：淳安县县丞吴茂育，告假回家期间，刊刻《求志编》二册，“语多狂悖。”其中有关讲学各类，大多拾他人唾弃不要的言论。评论古人则语言感慨，词气不平，信口妄谈，毫无忌惮。书前李沛霖的序言只落款癸卯九月，不书写雍正元年，再次触犯规定。雍正帝朱批：“地方上匪类之为国家生民、世道人心害，甚于盗贼远矣。”旨命严加究审。雍正十三年，江西黄廷臣、黄森官父子因开店折本，与傅秀山联手立“三皇圣祖教”。附从的人十分多，于是黄森官又派人到浙江，经与吴士荣相通并附札会，吴士荣自称“文阳王”，下设“天元帅”若干人，宣传天下将大乱，领札者可保身家性命兼得官位，借以骗人财物。程元章作为浙江总督，将-有关人犯一一捕获，并通知江西，追捕主犯。同时，程元章将以上情况上奏朝廷。此后，黄森官等主犯被捕获，搜得大量札会、兵书和旗帜等。一月有余，尚书奉命前往浙江，与程元章等会审-，平息妖孽。同年，由于海塘工程拖延工期，程元章将所有工程交杭州副都统隆升办理，御史编武协助。程元章负责运办物料和给放钱粮等项。这一年十月，程元章以总督衔，专管浙江巡抚，及两浙盐政事。雍正十四年，程元章疏奏：雍正七年和雍正十年已垦老荒田一百八十顷三十五亩，依例该年应升科税。同年，因海塘工程无进展，程元章被解任回京。雍正十五年，程元章去世。著有《师洛堂诗集》。